Ludzkie koronawirusy - autor: Krzysztof Pyrć z Zakładu Mikrobiologii, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński, Kraków

Zastanawiasz się, jak wydać pracę doktorską, habilitacyjną lub monografię? Chcesz dokonać zmian w stylistyce i interpunkcji tekstu naukowego? Nic prostszego! Zaufaj Wydawnictwu Borgis – wydawcy renomowanych książek i czasopism medycznych. Zapewniamy przede wszystkim profesjonalne wsparcie w przygotowaniu pracy, opracowanie dokumentacji oraz druk pracy doktorskiej, magisterskiej, habilitacyjnej. Dzięki nam nie będziesz musiał zajmować się projektowaniem okładki oraz typografią książki.

Poniżej zamieściliśmy fragment artykułu. Informacja nt. dostępu do pełnej treści artykułu tutaj
© Borgis - Postępy Nauk Medycznych 4/2005, s. 3-6
Agnieszka Wypych1, Jadwiga Kulik2, Janusz Siedlecki2, Michał Matysiak1
Wczesne wykrywanie zajęcia ośrodkowego układu nerwowego u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną badaniem płynu mózgowo-rdzeniowego metodą PCR
Early detection of central nervous system involvement in children with acute lymphoblastic leukemia by cerebrospinal fluid examination using PCR technique
1 Katedra i Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii AM w Warszawie
Kierownik Kliniki: prof. dr hab. n. med. Michał Matysiak
2 Zakład Biologii Molekularnej Centrum Onkologii – Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie
Kierownik Zakładu: prof. dr hab. n. biol. Janusz Siedlecki
Streszczenie
>Wstęp. Białaczki stanowią 30% chorób nowotworowych wieku dziecięcego. Najczęstszą postacią białaczki, występującą u dzieci w 80-85%, jest ostra białaczka limfoblastyczna (ALL).
W komórkach blastów dochodzi do rearanżacji genów dla łańcuchów ciężkich i lekkich immunoglobulin w B-ALL i receptora antygenowego limfocytów T w T-ALL. Jedną z technik biologii molekularnej stosowaną do badania przegrupowań w obrębie genów dla łańcuchów ciężkich (IgH) i lekkich immunoglobulin oraz receptora antygenowego limfocytów T (TCR) jest reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR).
Materiały i metody. Badaniami objęto 50 dzieci hospitalizowanych w Katedrze i Klinice Pediatrii, Hematologii i Onkologii Akademii Medycznej w Warszawie w latach 1998-2002. Ocena zajęcia ośrodkowego układu nerwowego przez proces nowotworowy przeprowadzona była w oparciu o badanie płynu mózgowo-rdzeniowego metodą PCR na obecność rearanżacji genów IgH i TCRd.
Wyniki. Przed rozpoczęciem leczenia białaczki, obecność badanych przegrupowań wykryto w płynie mózgowo-rdzeniowym u 18 pacjentów (36% badanej grupy). W grupie tej, aż u 16 z nich utrzymywały się one przez cały okres chemioterapii, a także po jej zakończeniu.
Spośród 18 pacjentów, u których w chwili rozpoznania I rzutu białaczki wykryto w płynie mózgowo-rdzeniowym obecność badanej rearanżacji, wznowa z OUN wystąpiła u 4 dzieci. Dwoje z nich miało izolowaną wznowę w obrębie OUN i zmarło w trakcie leczenia. Pozostali dwaj pacjenci rozwinęli wczesną wznowę mieszaną – szpik + OUN. U nich udało się osiagnąć remisję i żyją oni nadal.
Wnioski. 1. Badanie płynu mózgowo-rdzeniowego metodą PCR pozwala na wykrycie komórek nowotworowych w OUN. 2. Monitorowanie obecności rearanżacji badanych genów pozwala na wyodrębnienie grupy pacjentów narażonych na wystąpienie nawrotu białaczki zlokalizowanej w OUN. 3. Nawrót białaczki w obrębie OUN występuje jedynie wśród dzieci, u których stwierdzono obecność komórek nowotworowych badaniem PCR w pierwszym rzucie choroby.
Summary
Introduction. 30% children neoplastic dideases are leukemias. The most frequent (80-85%) type of children leukemia is acute lymphoblastic leukemia (ALL).
Gene rearrangements come into effect in blasts cells for heavy and light immunoglobulin chains in B-ALL and T lymphocytes antigenic receptor in T-ALL. One of molecular biology technology applied to analyse gene region regrouping for heavy (IgH) and light immunoglobulin chains and T lymphocytes antigenic receptor (TCR) is polymerase chain reaction (PCR).
Materials and methods. 50 children hospitalised in Pediatric Hematology/Oncology Clinic of Medical University of Warsaw were examined in years 1998-2002. Assesment of central nervous system involvement by neoplastic progress was based on cerebrospinal fluid examination using PCR, whitch detected IgH and TCRd genes rearrangements.
Results. 18 patients (i.e. 36% of examined group) had the genes rearrangements detected in cerebrospinal fluid just before start of leukemia treatment. As much as 16 people from the group had genes rearrangements existed during chemotherapy and after. Leukemia relapse in central nervous system followed in 4 children from among 18, which had primary leukemia diagnosed and presence of gene rearranged in cerebrospinal fluid detected. Two of them had isolated relapse in central nervous system and have died during treatment. Early mixed relapse (bone marrow + central nervous system) were observed in two remained. Remission were achieved and the two is still alive.
Conclusions. 1. Cerebrospinal fluid examination using PCR can detect neoplastic cells in central nervous system.
2. Gene rearrangements monitoring allow to separate groups of patients exposed to leukemia relapse in central nervous system. 3. Leukemia relapse in central nervous system appears in children when neoplastic cells are detected by PCR during primary leukemia diagnosed.
WSTĘP
Najczęstszą postacią białaczki u dzieci jest w 80-85% ostra białaczka limfoblastyczna (ALL) (10). Istotą tego procesu nowotworowego jest klonalny rozrost limfoidalnych komórek prekursorowych linii B lub T. Dzięki rozwojowi technik biologii molekularnej możliwe było poznanie charakterystycznych zmian w genotypie komórek białaczkowych, i tak: w ALL wywodzącej się z limfocytów T w ponad 90% przypadków występuje kompletne przegrupowanie TCRg, a w około 70% przegrupowanie TCRb, rzadziej, bo tylko w 55-60% obserwuje się kompletne przegrupowanie TCRd i TCRa. W ALL z linii B przegrupowania genów TCR kształtują się następująco: dla TCRd 70%, TCRa 30-59%, TCRg 40-70%, TCRb 31-35%. W 50% przypadków białaczki pre-B-ALL i aż w 90% przypadków B-ALL występują kompletne przegrupowania IgH (3, 9, 11).
Poprzez analizę przegrupowań genów TCR i IgH można określić tzw. molekularny obraz ( fingerprint) charakterystyczny dla każdego pacjenta. Molekularny obraz pozwala w przypadku ALL na ocenę stopnia zaawansowania procesu nowotworowego przez określenie ewentualnego naciekania poszczególnych narządów np. OUN.
Odrębnym problemem badawczym, niezwykle istotnym z punktu widzenia pacjenta, jest poszukiwanie przetrwałych po leczeniu komórek nowotworowych. Dzięki badaniom przegrupowań genów IgH i TCR wiadomo, iż prawie we wszystkich przypadkach nawrotów choroby ich bezpośrednią przyczyną jest proliferacja przetrwałego, oryginalnego klonu białaczkowego. Wykrycie nawet najmniejszej liczby komórek nowotworowych ( minimal residual disease – MRD) może sugerować pojawienie się nawrotu choroby. Najczulszą metodą wykrywania MRD jest obecnie łańcuchowa reakcja polimerazy – PCR, polegająca na amplifikacji określonych sekwencji DNA. Metoda ta znalazła swoje miejsce w standardowym postępowaniu klinicznym u pacjentów z ostrą białaczką limfoblastyczną.
Wydaje się, że za sprawą czułości omawianej metody, która pozwala wykryć jedną nieprawidłową komórkę na milion prawidłowych, a także dzięki temu, iż w przypadku ALL rozrost nowotworowy jest rozrostem monoklonalnym, PCR może znaleźć zastosowanie także w wykrywaniu komórek białaczkowych w obrębie OUN (1, 4, 5, 9, 13).
MATERIAŁ I METODY
Badaniami objęto 50 dzieci hospitalizowanych w Katedrze i Klinice Pediatrii, Hematologii i Onkologii Akademii Medycznej w Warszawie w latach 1998-2002. Grupę tę stanowiło 45 dzieci leczonych z powodu pierwszego rzutu ALL oraz pięcioro dzieci, u których w trakcie leczenia wystąpiła wznowa białaczki. Płyn mózgowo-rdzeniowy pobierano od każdego pacjenta przynajmniej czterokrotnie: przed rozpoczęciem leczenia, dwa razy w trakcie chemioterapii oraz podczas ostatniego nakłucia przewidzianego w protokole leczenia. Do izoloacji DNA stosowano zamiennie jedną z trzech metod: uwalnianie metodą gorącą (4), przy użyciu Tweenu i współwytrącanie z poliakrylamidem. Pierwsza z nich została zaczerpnięta z piśmiennictwa, pozostałe opracowano samodzielnie. W celu potwierdzenia obecności materiału genetycznego wykonywano pojedynczą reakcję PCR ze starterami GAPDH1 i GAPDH2 amplifikującymi gen markerowy.
Ocenę zajęcia OUN przez proces nowotworowy przeprowadzono w oparciu o badanie płynu mózgowo-rdzeniowego metodą dwustopniowej reakcji PCR z użyciem starterów dla genów IgH i TCRd. Mieszanina reakcyjna PCR o objętości końcowej 25 ml zawierała: 5 ml DNA, 0,3 ml każdego ze starterów o stężeniu 0,1 mg/mml, 4 ml 1,25 mM dNTP, 2,15 ml 25 mM chłorku magnezu, 2,5 ml buforu do PCR, 0,15 ml polimerazy DNA JumpStart i wodę dejonizowaną. Reakcję przeprowadzano w automatycznym aparacie do PCR firmy PerkinElmer. W każdym przeprowadzonym badaniu wykonywano również próbę ujemną, poddając reakcji PCR DNA wyizolowane z krwi obwodowej osób zdrowych i/lub łożyska. Kontrolowano również czystość samej mieszaniny reakcyjnej bez dodatku materiału genetycznego.
Obecność przegrupowań genów IgH i TCRd badano przeprowadzając dwustopniową reakcję PCR: pierwsza ze starterami FR3A i LJH dla łańcuchów ciężkich immunoglobulin oraz Vd2 i Dr3 dla łańcucha TCRd; do drugiej reakcji używano 1 ml produktu pierwszej reakcji i stosowano następujące pary starterów: Fr3A i VLJH oraz Vd2 i Dr3. Warunki obydwu amplifikacji były identyczne: wstępna denaturacja przez 7 minut w temperaturze 94°C, następnie 30 cykli: 30 sekundowa denaturacja w temperaturze 94°C, 30 sekundowe równoważenie starterów w temperaturze 55°C i 30 sekundowe wydłużanie w temperaturze 72°C. Uzyskany produkt reakcji poddawano elektroforezie w 3% żelu agarozowym, oglądano w świetle UV i wykonywano dokumentację fotograficzną badań.
WYNIKI
Celem wykrycia komórek białaczkowych w płynie mózgowo-rdzeniowym wykonywano badanie PCR z użyciem starterów dla genów IgH i TCRd. Badanie przeprowadzono w 50 przypadkach ostrej białaczki limfoblastycznej przynajmniej czterokrotnie na różnych etapach procesu chorobowego. O dodatnim wyniku badania świadczyła obecność prążka wielkości 90-120 bp będącego odzwierciedleniem zamplifikowanego przegrupowania VDJ. Przed rozpoczęciem leczenia białaczki, obecność badanych rearanżacji wykryto w płynie mózgowo-rdzeniowym u 18 pacjentów (36% badanej grupy).
Wśród 18 dzieci, u których stwierdzono obecność rearanżacji genów dla łańcuchów ciężkich immunoglobulin i receptora limfocytów T było 14 pacjentów z C-ALL (77,7% wyników dodatnich), 2 pacjentów z T-ALL (11,1%) i 2 pacjentów z pre-B-ALL (11,1%).
Nie u wszystkich dzieci amplifikacja fragmentu CDR-III łańcucha ciężkiego immunoglobulin pokrywała się z jednocześnie występującą amplifikacją genu TCRd. Amplifikację genu IgH stwierdzono u 17 (34%) pacjentów, genu TCRd u 15 (30%). Nie stwierdzono rearanżacji o charakterze biklonalnym czy też oligoklonalnym.
Z DNA wyizolowanego z prawidłowego szpiku kostnego lub łożyska nie uzyskano produktu amplifikacji segmentów genu IgH oraz TCRd, co wskazuje na poliklonalny charakter przegrupowań występujących u osób zdrowych.

Powyżej zamieściliśmy fragment artykułu, do którego możesz uzyskać pełny dostęp.

Płatny dostęp do wszystkich zasobów Czytelni Medycznej

Aby uzyskać płatny dostęp do pełnej treści powyższego artykułu oraz WSZYSTKICH około 7000 artykułów Czytelni, należy wprowadzić kod:

Kod (cena 30 zł za 30 dni dostępu) mogą Państwo uzyskać, przechodząc na tę stronę.
Wprowadzając kod, akceptują Państwo treść Regulaminu oraz potwierdzają zapoznanie się z nim.

Piśmiennictwo
1. Bartram C.R., et al.: „Detection of minimal residual leukemia by polymerase chain reaction: potential implications for therapy” Clin. Chim. Acta, 1993, 217, 75-83.
2. Ganick D.J., et al.: „Leukemia presenting as central nervous system disease without bone marrow involvement” Med. Ped. Oncol. 1983, 11, 229-232.
3. Ghali D.W., et al.: „Heterogeinity of the T-cell receptor d gene indicating subclone formation in acute precursor B-cell leukemia” Blood, 1995, 85, 2795-801.
4. Januszkiewicz-Lewandowska D.: „Przegrupowania genów dla immunoglobulin i receptora antygenowego limfocytów T w chorobach limfoproliferacyjnych u dzieci” Praca habilitacyjna, Poznań, 2000.
5. Januszkiewicz D.A., et al.: „Molecular evidence for central nervous sysytem involvement in children with newly diagnosed acute limphoblastic leukemia” Hematological Oncology, 1995, 13, 201-206.
6. Kostler W.J., et al.: „Detection of minimal residual disease in patient with cancer: a review of techniques, clinical implications, and emerging therapeutic consequences” Cancer Detect. Prev. 2000, 24, 376-403.
7. Li X., et al.: „Detection of minimal leukemic cells in celebral spinal fluid of children with acute lymphoblastic leukemia using the polymerase chain reaction technique” Journal of Tongji Medical University, 1998, 18(1), 49-53.
8. Pinkel D., et al.: „Prevention and treatment of meningeal leukemia in children” Blood 1994, 84, 355.
9. Raciborska A.: „Monitorowanie choroby resztkowej u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną metodą PCR” Praca doktorska, Warszawa, 2002.
10. Radwańska U., i wsp.: „ Białaczki u dzieci” Volumed, Wrocław 1998.
11. Rezuke W.N., et al.: „Molecular diagnosis of B-and T-cell lymphomas: fundamental principles and clinical applications” Clin. Chem. 1997, 43, 1814-24.
12. Shiramizu A., et al.: „Monitoring of celebral spinal fuid by polymerase chain reaction in children with acute lymphoblastic leukemia” International Journal of Pediatric Hematology/Oncology 1998, 5(6), 475-83.
13. Trainor K.J., et al.: „Monoclonality in B-lymphoproliferative disorders detected at the DNA level” Bllod, 1990, 75, 2220-22.
Postępy Nauk Medycznych 4/2005
Strona internetowa czasopisma Postępy Nauk Medycznych